Mehrere Spitzenwerte aus einer Messreihe erkennen

Ich würde es in drei Schritten probieren.
1. Mit dem Peak-Finder alle Maxima suchen.
2. Von den gefundenen Maxima mit dem Peak-Finder das Minimum in der Mitte suchen. Damit solltest Du recht zuverlässig die gefunden Maxima in die zwei relevanten Bereiche aufteilen können.
3. Das größte Maximum in den zwei Bereichen bestimmen. Fertig.

Gruß Holger