Queued State Machine, paralleles lesen und schreiben.

Ich würde diese höher angesiedelten Fragen erst mal hintenanstellen und im ersten Schritt mich erst mal darum kümmern, dass die serielle Komnikation in beiden Richtungen sauber und stabil und läuft.
Dann würde ich das VI nebst Erläuterung zum Datenprotokoll hier posten und die Frage noch mal stellen.
Datenprotokoll: Das erscheint mir ungewöhnlich zu sein. Die Quelle sendet unaufgefordert, es wird also laufend vom PC empfangen, und beim Senden kommt es manchmal darauf an, dass das sofort nach einem bestimmten enmpfangenen Datensatz geschieht, bevor der nächste Datensatz abgeschickt wurde. Das ist aber mit dem Prinzip der Pufferung nicht richtig vereinbar, ich kann mir so keinen stabilen Betrieb vorstellen.
Normal wäre in so einem Fall der Master-Slave-Modus: Die Quelle sendet jeden Datensatz nur auf Anfrage, sonst nicht.