Programmieren mit Atmel Studio 6.1

Haha ok ich versuche es noch einmal, sorry wenn ich zu ungenau war.

Ich muss eine Platine testen(Kleine Platine im Anhang)
Dazu stecke ich sie auf den Adpter(Andres Bild im Anhang)

Ich mache dan zunächst einige Messungen und will dann, den uP auf meiner Plantine programmieren, ohne ihn auszustecken oder irgendwas.
Dazu ist ja der Programmierstecker(unten rechts auf der Adapterplatine) da.

Ich möchte diesn ganzen Vorgang automatisieren, so das ich nicht extra den Prüfablauf unterbrechen muss um den uP zu programmieren.

Also
-Einige Test
-Atmel Studio aufrufen
-Device etc. wählen
-Programm wählen
-uP programmiern
-AtmelStudio schliessen
-weiter Test machen
....