Längere Wartezeit im Programmablauf

Du könntest z.B. ein seperates VI aufrufen, das Schließen/Minimieren dieses VIs verbieten und es auf Modal setzen. Damit erzwingst du quasi, dass der Timer auf dem Schirm bleibt. Rufst du dieses VI asynchron auf, könntest du sogar noch im Hintergrund weitermachen, aber das ist ja nicht das was du machen willst, wenn ich deiner Schilderung folge.

Hier ein Ansatz:
Das aufgerufene VI nimmt zunächst eine Startzeit. Mit minimaler Mathematik und "Get Date/Time in seconds" lässt sich daraus ein Timer bauen. Find ich persönlich besser als bloß eine Zeit abzuwarten, da es dir die Flexibilität lässt, während des Wartens zu agieren (user Events z.B.).