Programm läuft nach kompilierung nicht mehr!

Prüfe doch mal, ob Du eine Race-Condition hast, d.h. ob es Programmteile gibt, die gleichzeitig laufen, wo es aber wichtig ist in welcher Reihenfolge sie abgearbeitet werden /fertig sind.
Bei der Kompilierung ändert sich das Laufzeitverhalten: die Optimierung funktioniert nicht bei allen Abläufen gleich gut, so dass vormals schnellere Funktionen nun vielleicht von den Nachzüglern überholt werden.