Synchronisation ai und do

Guten morgen,

ich habe ein kleines Problem mit der Synchronisation zwischen einem Digital-Out und einem analog-In Signal. Ich benutze als Microcontroller den USB6008.
Ich möchte damit gerne ein Pulsoxymeter bauen. Es sollen abwechselnd zwei LED´s geschaltet werden und dabei das Licht gemessen werden was auf der anderen seite des Fingers durchkommt. Das Takten der LED´s habe ich soweit hinbekommen nur misst mein Sensor zu früh und erwischt immernoch Daten von der LED die eigentlich aus sein sollte während dem Schleifendurchgang obwohl ich schon eine Sequenzielle Abarbeitung reingebaut habe. Ich würde mich über eure Hilfe sehr freuen.

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